MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 4242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011984	GCCG	2	8	175173	175180	0 %	0 %	50 %	50 %	222083289
3502	NC_011984	TGC	2	6	175201	175206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083289
3503	NC_011984	CAT	2	6	175232	175237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083289
3504	NC_011984	ACG	2	6	175303	175308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083289
3505	NC_011984	CGC	2	6	175319	175324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083289
3506	NC_011984	TCA	2	6	175396	175401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083289
3507	NC_011984	CTG	2	6	175440	175445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083289
3508	NC_011984	GCG	2	6	175541	175546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_011984	CTC	2	6	175548	175553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_011984	TCCG	2	8	175630	175637	0 %	25 %	25 %	50 %	222083290
3511	NC_011984	CCA	2	6	175638	175643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083290
3512	NC_011984	TCCTG	2	10	175686	175695	0 %	40 %	20 %	40 %	222083290
3513	NC_011984	CAT	2	6	175704	175709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083290
3514	NC_011984	GGC	2	6	175738	175743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083290
3515	NC_011984	CTG	2	6	175748	175753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083290
3516	NC_011984	TGA	2	6	175765	175770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083290
3517	NC_011984	CCG	2	6	175914	175919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083290
3518	NC_011984	TGC	2	6	175956	175961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083290
3519	NC_011984	CTA	2	6	175987	175992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083290
3520	NC_011984	CAT	2	6	176005	176010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083290
3521	NC_011984	GCG	3	9	176075	176083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083290
3522	NC_011984	CG	3	6	176145	176150	0 %	0 %	50 %	50 %	222083290
3523	NC_011984	GAT	2	6	176161	176166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083290
3524	NC_011984	CG	3	6	176178	176183	0 %	0 %	50 %	50 %	222083290
3525	NC_011984	TCG	2	6	176226	176231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083290
3526	NC_011984	A	6	6	176255	176260	100 %	0 %	0 %	0 %	222083290
3527	NC_011984	CCA	2	6	176262	176267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083290
3528	NC_011984	CGG	2	6	176275	176280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083290
3529	NC_011984	CGG	2	6	176359	176364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083290
3530	NC_011984	GT	4	8	176369	176376	0 %	50 %	50 %	0 %	222083290
3531	NC_011984	CTC	2	6	176377	176382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083290
3532	NC_011984	TCG	3	9	176394	176402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083290
3533	NC_011984	ACG	2	6	176412	176417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083290
3534	NC_011984	CGA	2	6	176481	176486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083290
3535	NC_011984	CTC	2	6	176500	176505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083290
3536	NC_011984	CGA	2	6	176518	176523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083290
3537	NC_011984	CCG	2	6	176582	176587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083290
3538	NC_011984	TTC	2	6	176666	176671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083290
3539	NC_011984	GAG	2	6	176705	176710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083290
3540	NC_011984	TGG	2	6	176749	176754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083290
3541	NC_011984	GAA	2	6	176776	176781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083290
3542	NC_011984	ATC	2	6	176829	176834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083290
3543	NC_011984	GGC	2	6	176864	176869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083290
3544	NC_011984	CGT	2	6	176944	176949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083290
3545	NC_011984	CGT	2	6	177006	177011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083291
3546	NC_011984	GAG	2	6	177040	177045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083291
3547	NC_011984	CCGG	2	8	177057	177064	0 %	0 %	50 %	50 %	222083291
3548	NC_011984	CGC	2	6	177090	177095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083291
3549	NC_011984	GCC	2	6	177124	177129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083291
3550	NC_011984	AAGG	2	8	177226	177233	50 %	0 %	50 %	0 %	222083291
3551	NC_011984	CGG	2	6	177291	177296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083291
3552	NC_011984	AAC	2	6	177317	177322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083291
3553	NC_011984	TCG	2	6	177413	177418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083291
3554	NC_011984	GTC	2	6	177496	177501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083291
3555	NC_011984	GGT	2	6	177514	177519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083291
3556	NC_011984	CGA	2	6	177582	177587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083291
3557	NC_011984	GAA	2	6	177666	177671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083291
3558	NC_011984	CGG	2	6	177678	177683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083291
3559	NC_011984	GGTC	2	8	177744	177751	0 %	25 %	50 %	25 %	222083291
3560	NC_011984	GCC	2	6	177780	177785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083291
3561	NC_011984	TCT	2	6	177950	177955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083291
3562	NC_011984	CAT	2	6	177964	177969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083291
3563	NC_011984	GCC	2	6	178154	178159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_011984	C	7	7	178158	178164	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3565	NC_011984	ATC	2	6	178221	178226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_011984	GAAG	2	8	178357	178364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_011984	AGG	2	6	178388	178393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_011984	AAC	2	6	178463	178468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_011984	TCC	2	6	178542	178547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_011984	GATC	2	8	178565	178572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_011984	TCT	2	6	178577	178582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_011984	TGA	2	6	178615	178620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_011984	GCA	2	6	178652	178657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_011984	ACC	2	6	178663	178668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_011984	T	6	6	178738	178743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_011984	GCA	2	6	179094	179099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083292
3577	NC_011984	GCG	2	6	179186	179191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083292
3578	NC_011984	GTT	2	6	179242	179247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083293
3579	NC_011984	CCG	2	6	179295	179300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083293
3580	NC_011984	CGGT	2	8	179354	179361	0 %	25 %	50 %	25 %	222083293
3581	NC_011984	GCG	2	6	179376	179381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083293
3582	NC_011984	GCG	2	6	179411	179416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083293
3583	NC_011984	GGC	2	6	179463	179468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083293
3584	NC_011984	GGT	2	6	179473	179478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083293
3585	NC_011984	CGA	2	6	179508	179513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083293
3586	NC_011984	CCA	2	6	179535	179540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083293
3587	NC_011984	CGC	2	6	179581	179586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083293
3588	NC_011984	ATG	2	6	179621	179626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083293
3589	NC_011984	GCT	2	6	179668	179673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083293
3590	NC_011984	CTTT	2	8	179691	179698	0 %	75 %	0 %	25 %	222083293
3591	NC_011984	TCC	2	6	179715	179720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_011984	GCG	2	6	179788	179793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083294
3593	NC_011984	CTTC	2	8	179842	179849	0 %	50 %	0 %	50 %	222083294
3594	NC_011984	CG	3	6	179887	179892	0 %	0 %	50 %	50 %	222083294
3595	NC_011984	CGGC	2	8	179959	179966	0 %	0 %	50 %	50 %	222083294
3596	NC_011984	AGC	2	6	179980	179985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083294
3597	NC_011984	TCG	2	6	180241	180246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083294
3598	NC_011984	CGG	2	6	180254	180259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083294
3599	NC_011984	TCG	2	6	180325	180330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083294
3600	NC_011984	CCG	2	6	180481	180486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083294
3601	NC_011984	TGG	2	6	180502	180507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083294
3602	NC_011984	GC	3	6	180510	180515	0 %	0 %	50 %	50 %	222083294
3603	NC_011984	CCGG	2	8	180517	180524	0 %	0 %	50 %	50 %	222083294
3604	NC_011984	TCG	2	6	180616	180621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083294
3605	NC_011984	GGC	2	6	180707	180712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083294
3606	NC_011984	GC	3	6	180724	180729	0 %	0 %	50 %	50 %	222083294
3607	NC_011984	GCC	2	6	180777	180782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083294
3608	NC_011984	GCG	2	6	180823	180828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083294
3609	NC_011984	GCG	2	6	180833	180838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083294
3610	NC_011984	GCG	2	6	180910	180915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083294
3611	NC_011984	GCC	2	6	180960	180965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083294
3612	NC_011984	GC	3	6	181032	181037	0 %	0 %	50 %	50 %	222083294
3613	NC_011984	CGC	2	6	181048	181053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083294
3614	NC_011984	TCG	2	6	181096	181101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083294
3615	NC_011984	GAA	2	6	181197	181202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083294
3616	NC_011984	GCC	2	6	181271	181276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_011984	GCC	2	6	181342	181347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_011984	CCA	2	6	181377	181382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_011984	CG	3	6	181512	181517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_011984	GCC	2	6	181520	181525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_011984	TGG	2	6	181532	181537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_011984	GCT	2	6	181551	181556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_011984	GC	3	6	181589	181594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_011984	ACA	2	6	181618	181623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3750	NC_011984	GAT	2	6	187457	187462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3751	NC_011984	CGG	2	6	187542	187547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3752	NC_011984	ACA	2	6	187548	187553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3753	NC_011984	GCTG	2	8	187601	187608	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3754	NC_011984	ACC	2	6	187616	187621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3755	NC_011984	GAT	2	6	187636	187641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3756	NC_011984	GGT	2	6	187757	187762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3757	NC_011984	ATC	2	6	187894	187899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3760	NC_011984	CAT	2	6	188020	188025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3765	NC_011984	TCG	2	6	188344	188349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083299
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3814	NC_011984	TCTA	2	8	191284	191291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3855	NC_011984	CTG	2	6	193622	193627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3856	NC_011984	A	6	6	193667	193672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3857	NC_011984	A	7	7	193678	193684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3858	NC_011984	TGC	2	6	193726	193731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3863	NC_011984	CGCAC	2	10	194031	194040	20 %	0 %	20 %	60 %	222083305
3864	NC_011984	GACG	2	8	194075	194082	25 %	0 %	50 %	25 %	222083305
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3999	NC_011984	CGA	2	6	200346	200351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083311
4000	NC_011984	ACC	2	6	200435	200440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083311

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